Tento rok řešilo 69 studentů, poslední sérii poslalo 25 středoškoláků. Seriál na pokračování byl opět obsáhlý, pojednával o kvantové fyzice a jeho autorem byl Jarda Trnka. Podzimní soustředění se konalo od 14. do 21. října 2006 ve Škrdlovicích, autorem Star Trek legendy byl Karel Tůma. Jarní soustředění bylo od 21. do 28. dubna 2007 v Budišově u Třebíče, legendu připravil Pavel Brom. Dne 20. prosince 2006 se konalo první FYKOSí Fyziklání v posluchárně F1, zúčastnilo se ho 21 pětičlenných týmů. Na tradiční Den s experimentální fyzikou navázal Týden s~aplikovanou fyzikou (2. až 5. dubna 2007), jehož organizátory byli Pavel Brom a Honza Prachař. TSAFu se zúčastnilo 27 řešitelů. Mimojiné jsme navštívili areál AÚ AV v Ondřejově, JE Dukovany a VD Dalešice. Do rozpočtu FYKOSu tento rok také přispěla Skupina ČEZ za její propagaci na soustředění, TSAFu a v ročence.